鼻咽拭子和咽拭子不一样，主要体现在采取标本的部位以及阳性率方面。
一、采取标本的部位不同：1.鼻咽拭子主要采取鼻粘膜部位的分泌物。目前在进行鼻咽拭子标本采集时，通常不会引起明显不适，但如果鼻腔结构存在异常情况，采集标本时可能会引发疼痛，所以操作时动作一定要轻柔且手法要正确。2.咽拭子则是在口咽部留取标本，需要采集咽喉处的分泌物进行检测。在操作过程中容易刺激到咽喉部，部分人可能会出现恶心或呕吐等不良反应
二、阳性率不同：一般来说，鼻咽部的阳性率要高于口咽部检测。所以对于有接触史的人群，采用鼻咽拭子检测能提高确诊率。
总之，鼻咽拭子和咽拭子在多个方面存在差异，在实际应用中需根据具体情况合理选择和运用。