鼻拭子和咽拭子主要有以下区别：一是留取标本的位置不同，咽拭子在咽部，患者张口即可操作，相对简单，临床常用，但取样者暴露风险高；鼻拭子需深入鼻腔，用较长拭子缓缓旋转送至鼻腔深部。二是使用的材质不同，鼻拭子材质较软以便深入鼻腔深部，而咽拭子材质情况未具体说明。此外，鼻拭子取材过程可能比咽拭子时间长，少数患者取样后可能出现喷嚏反射，可用手肘或纸巾遮挡。
一、留取标本位置：1.咽拭子：是在患者的咽部进行操作，患者只需张口，操作较为简便。这种方式在临床上较为常用
2.鼻拭子：需要将拭子深入到鼻腔里，不是外鼻腔，而是要到达鼻腔深部，这就需要使用比较长的拭子来完成。
二、使用材质：1.鼻拭子：其材质比较柔软，这是为了能够顺利通过鼻腔并到达鼻腔深部
2.咽拭子：文中未明确提及咽拭子具体的材质特点。
三、其他方面：鼻拭子在采取过程中可能花费的时间比咽拭子要长一些。并且少数患者在进行鼻拭子取样后有可能会出现喷嚏反射，此时患者可以用手肘或纸巾对局部进行遮挡，以避免一些不必要的情况发生。
总之，鼻拭子和咽拭子在留取标本位置、使用材质以及一些操作细节和后续反应上存在差异。在实际应用中需根据具体情况选择合适的方式。