引起三叉神经痛的原因有多种，其中血管压迫是较为常见的因素，约有超过 90%的原发性三叉神经痛是由于颅内血管对三叉神经根部产生压迫所致。
血管压迫因素
血管畸形压迫： 颅内存在异常的血管畸形时，畸形的血管可能会持续对三叉神经造成压迫，从而引发疼痛。这种情况相对较为少见，但一旦出现，就可能导致三叉神经痛的发生。动脉硬化血管压迫： 随着年龄增长，动脉硬化的发生概率增加，硬化的动脉血管可能会逐渐对三叉神经产生压迫，尤其在中老年人中较为常见。
神经源性因素
神经脱髓鞘病变： 三叉神经的神经纤维出现脱髓鞘改变时，神经的正常传导功能受到影响，容易产生异常的神经冲动，进而引发疼痛。比如一些自身免疫相关因素可能会导致神经脱髓鞘，从而诱发三叉神经痛。神经损伤后再生： 当三叉神经受到外伤等因素导致损伤后，在修复再生过程中可能会出现异常的神经冲动传导，也可能引发三叉神经痛。
疾病相关因素
肿瘤压迫： 颅内的一些肿瘤，如听神经瘤、脑膜瘤等，当肿瘤生长到一定程度时，可能会压迫三叉神经，从而引起疼痛。这种情况相对来说是因为肿瘤的占位效应导致神经受压而引发疼痛。感染性疾病影响： 如脑炎、脑膜炎等感染性疾病，可能会波及三叉神经，导致神经功能紊乱，引发三叉神经痛。不过这种情况在临床上相对较少见，但一旦发生感染累及三叉神经，就可能出现疼痛症状。