亚临床甲状腺功能减退症通常没有明显特异性症状，但部分患者可能有一些表现。约有25%-50%的亚临床甲减患者可能没有任何自觉症状。
代谢方面的表现
基础代谢率降低相关：部分患者会感觉怕冷，比正常人更易受寒冷影响，即使在较温暖的环境中也会有畏寒的情况。因为甲状腺激素能促进机体产热，亚临床甲减时甲状腺激素合成或分泌相对不足，导致基础代谢率下降，产热减少，所以怕冷较为常见。体重变化：有些患者可能出现体重轻微增加的情况。这是由于甲状腺激素不足会使身体代谢速度减慢，机体消耗能量减少，多余能量易转化为脂肪堆积，从而导致体重有所上升，但一般增重幅度不大，可能在1-3公斤左右波动。
神经系统相关表现
精神状态：部分患者会有精神萎靡、容易疲倦的感觉。甲状腺激素对神经系统有一定影响，亚临床甲减时神经兴奋性降低，患者会表现出精神不振，即使经过充足休息，仍感觉身体乏力、疲倦，日常活动后更容易疲劳。记忆力与注意力：可能出现记忆力减退，尤其是对近期发生的事情记忆模糊。同时注意力也较难集中，工作或学习时容易分心。这是因为甲状腺激素参与大脑的代谢调节等过程，缺乏时会影响神经系统的正常功能，进而导致记忆力和注意力方面出现问题。
心血管系统表现
心率变化：少数患者可能出现心率减慢的情况，一般心率可能在50-60次/分钟左右，而正常人静息心率多在60-100次/分钟。甲状腺激素能维持心脏的正常节律和收缩功能，亚临床甲减时甲状腺激素不足会影响心脏的正常代谢，导致心率减慢。血压方面：部分患者可能出现血压轻度升高的现象。甲状腺激素对血管的张力等有一定调节作用，甲状腺激素不足时，血管外周阻力可能会增加，从而引起血压轻度上升，但一般不会出现严重的高血压情况。
消化系统表现
食欲改变：有些患者会出现食欲减退的情况。甲状腺激素能促进胃肠道的蠕动和消化液的分泌，亚临床甲减时胃肠功能受到影响，蠕动减慢，消化液分泌相对不足，导致患者食欲下降，不想进食。便秘问题：容易发生便秘。由于胃肠蠕动减慢，食物在肠道内停留时间延长，水分被过度吸收，粪便干结，从而引起便秘，可能每周排便次数少于3次，且排便困难。