肠易激惹综合征的治疗药物需根据不同症状来选择。一般来说，缓解腹痛的药物常用匹维溴铵，它能选择性作用于胃肠道平滑肌，缓解肠道痉挛引起的疼痛，通常可长期服用。
缓解腹痛的药物：
匹维溴铵： 这是一种对胃肠道具有高度选择性解痉作用的钙拮抗药，它通过抑制钙离子流入肠道平滑肌细胞，达到松弛肠道平滑肌的作用，从而缓解肠易激惹综合征引起的腹痛症状，且副作用相对较少，可较长时间服用。
调节肠道菌群的药物：
双歧杆菌四联活菌片： 它含有双歧杆菌、嗜酸乳杆菌、粪肠球菌、蜡样芽孢杆菌等多种有益菌，这些有益菌可以调节肠道菌群平衡，改善肠道功能，对于肠易激惹综合征导致的肠道功能紊乱有一定的调节作用。一般来说，成人可根据病情遵医嘱服用，该药物安全性较好，不良反应较少见。枯草杆菌二联活菌颗粒： 里面包含枯草杆菌和屎肠球菌两种活菌，能够补充肠道有益菌，抑制有害菌的生长繁殖，维持肠道微生态平衡，有助于缓解肠易激惹综合征患者的腹胀、腹泻等症状，儿童也可使用，用温水冲服即可。
止泻药物：
洛哌丁胺： 适用于腹泻症状较明显的肠易激惹综合征患者。它可以抑制肠道平滑肌的收缩，减少肠蠕动，从而延长肠内容物的通过时间，起到止泻的作用。但需要注意，不能长期大剂量使用，以免引起便秘等不良反应。蒙脱石散： 它可以在肠道内形成一层保护膜，覆盖、保护肠道黏膜，吸附肠道内的毒素、病菌及多余的水分等，达到止泻的效果，对于肠易激惹综合征引起的腹泻有一定的缓解作用，儿童和成人都可使用，服用时需用适量温水冲服。