卵巢囊肿患者3个月没来月经，可能是由卵巢囊肿本身引起，也可能是怀孕、宫腔粘连等其他因素所致。患者应及时前往医院，明确原因后采取相应处理措施。
一、卵巢囊肿：
1.较小的卵巢囊肿通常无明显症状，但随着囊肿体积逐渐增大，可能会出现下腹部疼痛、腰痛、性交疼痛等表现。若囊肿巨大，可能会干扰月经，导致出现3个月不来月经的情况。
2.对于卵巢囊肿大于5cm的患者，可考虑进行囊肿剔除手术或患侧卵巢切除手术进行治疗。
二、怀孕：
1.若卵巢囊肿患者有正常性生活且未避孕，则可能怀孕。怀孕后子宫内膜不再有周期性变化，就会出现停经现象，此时与卵巢囊肿无关。
2.如果打算继续妊娠，可前往医院进行健康检查。若想终止妊娠，则需进行相关实验室检查，再确定终止妊娠的方式。
三、宫腔粘连：
1.若卵巢囊肿患者此前有过宫腔操作史，如人工流产等，可能导致子宫内膜损伤，进而引起宫腔粘连，从而出现3个月不来月经的情况。
2.建议在宫腔镜下分离粘连组织，同时放置节育环预防再次粘连。还可遵医嘱应用戊酸雌二醇片促进子宫内膜生长，以恢复正常月经。
总之，当卵巢囊肿患者出现3个月不来月经时，需要综合考虑多种因素，明确具体原因后进行针对性的处理。