卵巢囊肿患者出现3个月没来月经，可能的原因包括卵巢囊肿本身、怀孕、宫腔粘连等。患者应及时就医，明确原因后采取相应处理措施。
一、卵巢囊肿：
1.一般较小的卵巢囊肿通常无明显症状，但随着体积增大，可能引发下腹部疼痛、腰痛、性交疼痛等。巨大卵巢囊肿可能导致月经失调，进而出现3个月不来月经的情况。
2.对于卵巢囊肿大于5cm的患者，可采取囊肿剔除手术或患侧卵巢切除手术进行治疗。
二、怀孕：
1.若卵巢囊肿患者有正常性生活且未避孕，可能怀孕，怀孕后子宫内膜不再周期性变化，会出现月经不来，此时与卵巢囊肿无关。
2.如果打算继续妊娠，可前往医院进行健康检查。若想终止妊娠，则需进行相关实验室检查，以确定终止妊娠的方式。
三、宫腔粘连：
1.若卵巢囊肿患者此前有宫腔操作史，如人工流产等，导致子宫内膜损伤而引起宫腔粘连，也可能出现3个月不来月经。
2.建议在宫腔镜下分离粘连组织，同时放置节育环预防再次粘连，还可遵医嘱应用戊酸雌二醇片促进子宫内膜生长，使月经恢复正常。
总之，卵巢囊肿患者长时间不来月经可能有多种原因，需要仔细检查和诊断，以便采取正确的治疗措施。