小儿扁桃体发炎常用的药物主要有抗生素类和清热解毒类等。一般来说，细菌感染引起的扁桃体发炎可能需要使用抗生素，而病毒感染导致的多以对症治疗为主。
抗生素类药物
青霉素类：如果小儿对青霉素不过敏，可选用阿莫西林等。这类药物对多种细菌有抑制作用，能有效对抗引起扁桃体发炎的常见细菌。但使用前必须确认小儿无青霉素过敏史，若有过敏情况则不能使用。头孢菌素类：像头孢克肟等属于此类。它对革兰阳性菌和部分革兰阴性菌有较好的抗菌活性，可用于治疗敏感菌引起的扁桃体发炎。不过，使用头孢类药物前也需要询问过敏史，有头孢菌素过敏史的小儿禁用。
清热解毒类药物
小儿咽扁颗粒：具有清热利咽、解毒止痛的作用，可缓解小儿扁桃体发炎引起的咽喉肿痛等症状。它由金银花、射干、金果榄等中药成分组成，相对比较温和，适合小儿服用，但在服用时要按照说明书的剂量给小儿服用。蓝芩口服液：能清热解毒、利咽消肿，对小儿扁桃体发炎有一定的治疗作用。其主要成分有板蓝根、黄芩、栀子等，小儿服用时要注意观察有无不良反应，如出现腹泻等不适要及时停药。
对症缓解类药物
布洛芬混悬液：如果小儿扁桃体发炎伴有发热症状，体温超过38.5℃时可以使用。它能起到解热镇痛的作用，帮助小儿降低体温，缓解发热带来的不适。但要注意按照小儿的体重等正确使用剂量，不能过量服用。对乙酰氨基酚滴剂：也是常用的退热药物，适用于3个月以上的小儿。当小儿扁桃体发炎发热时，可在医生指导下使用，它通过抑制前列腺素的合成来发挥解热镇痛作用。同样要注意使用剂量和小儿的年龄等情况。需要注意的是，小儿扁桃体发炎用药需谨慎，一定要在医生的指导下进行，根据小儿的具体病情选择合适的药物，并且要密切观察小儿用药后的反应，如有异常及时就医。同时，在小儿患病期间，要让小儿多休息，多喝水，保持口腔清洁，有助于病情的恢复。