怀孕两个月腰疼，主要与以下原因有关：一是激素水平变化，二是子宫韧带拉长，三是缺钙。
一、激素水平变化：怀孕两个月处于孕早期，此时孕妇体内的雌激素和孕激素水平会有显著改变。受到激素水平影响，孕妇会出现关节韧带松弛的情况，进而导致盆腔组织与神经受到压迫，从而引发明显的腰痛症状。
二、子宫韧带拉长：怀孕两个月时，子宫已经开始增大，子宫周围的韧带会随之被拉长，这就会产生腰痛现象。
三、缺钙：怀孕后随着胎儿的逐渐发育成长，胎儿所需要的营养物质会越来越多。如果平时没有注意做到均衡膳食，合理补充营养，那么很容易在怀孕两个月左右就出现缺钙情况。当机体缺钙后，容易诱发骨质疏松，从而导致腰痛表现。
如果怀孕两个月腰疼比较严重，应及时去医院就诊，明确诊断后由医生指导进行对症处理。
总之，怀孕两个月腰疼可能是多种因素导致的，要根据具体情况进行分析和处理。