月经结束当天同房一般不会怀孕，但可能会对身体有一些影响。分析如下：
1.怀孕几率小：月经结束当天，通常还处于安全期，卵巢一般不会排卵，所以怀孕的几率较小。但也有额外排卵的可能，所以不能完全排除怀孕的可能。
2.感染风险：月经期间，子宫内膜脱落，宫腔有新鲜创面，且宫颈口扩张，此时同房，细菌可能上行感染，引起子宫内膜炎、盆腔炎等妇科炎症。
3.子宫内膜异位症：经期同房，还可能导致经血倒流，引起子宫内膜异位症，导致痛经、性交痛等。
4.免疫性不孕：经期同房，还可能导致精子抗体产生，引起免疫性不孕。
因此，建议尽量避免在经期同房，如果有同房需求，也应注意卫生，采取避孕措施，同时关注自身健康状况，如有不适，及时就医。