打喷嚏恶臭可能由多种原因引起，比如口腔卫生问题，若口腔清洁不到位，食物残渣残留，细菌滋生，就可能导致打喷嚏时有恶臭。一般来说，口腔卫生不良的人更容易出现这种情况。
口腔卫生因素
牙齿问题： 龋齿是常见导致口腔异味的原因之一。龋齿处容易残留食物，细菌分解食物产生异味，当打喷嚏时，这种异味可能随之散发出来。如果不及时治疗龋齿，情况可能会加重，异味也会更明显。牙周疾病： 像牙龈炎、牙周炎等牙周疾病，会使牙龈红肿、出血，且口腔内细菌大量繁殖，产生难闻的气味。有牙周疾病的人，口腔环境较差，打喷嚏时恶臭情况较易出现。
鼻腔鼻窦问题
鼻窦炎： 急性鼻窦炎患者鼻窦内会有炎症反应，产生脓性分泌物，这些分泌物含有大量细菌，会散发出恶臭气味。一般急性鼻窦炎发病较急，可能在数天内出现打喷嚏恶臭伴有鼻塞、流涕等症状。真菌性鼻窦炎： 真菌在鼻窦内生长繁殖，会引起鼻窦的炎症反应，导致鼻腔内分泌物有特殊的恶臭气味。真菌性鼻窦炎相对少见，但一旦发生，打喷嚏恶臭现象较为明显。
胃肠道问题
消化不良： 当出现消化不良时，食物在胃肠道内停留时间过长，发酵产生异味，可能通过食管反流至口腔，进而导致打喷嚏时有恶臭。例如，进食过多油腻、不易消化的食物后，就可能引发消化不良，出现相关症状。胃肠道感染： 如幽门螺杆菌感染引起的胃肠道炎症，会影响胃肠道的消化功能，产生异常气味，也可能导致打喷嚏时带有恶臭。幽门螺杆菌感染在人群中较为常见，需要引起重视。