耳朵根部疼痛可能由多种原因引起，以下是一些常见的原因和建议：
1.耳部感染：如外耳道炎、中耳炎等，通常还会伴有耳部瘙痒、听力下降等症状。可在医生的指导下使用抗生素滴耳液、口服抗生素等药物进行治疗。
2.颞下颌关节紊乱：咀嚼硬物、张口过大等可导致颞下颌关节功能紊乱，从而引起耳部疼痛。可通过热敷、按摩等方法缓解疼痛，同时要注意避免咀嚼硬物、张口过大等。
3.腮腺炎：可导致腮腺部位肿胀、疼痛，疼痛可放射至耳部。可在医生的指导下使用抗病毒药物、抗生素等进行治疗。
4.神经痛：如耳大神经痛、枕小神经痛等，可导致耳部放射性疼痛。可使用卡马西平、苯妥英钠等药物进行治疗，也可采取神经阻滞等方法进行治疗。
5.其他：耳部外伤、肿瘤等也可导致耳部疼痛。
如果出现耳朵根部疼痛的症状，建议及时就医，明确病因，在医生的指导下进行治疗。同时要注意休息，避免劳累，避免食用辛辣、刺激性食物。