憋尿后小便时尿道刺痛可能原因包括：长时间憋尿以及尿路感染等。具体情况如下：
一、长时间憋尿：患者若长期憋尿导致尿潴留，大量尿液积聚在膀胱中，使得膀胱肌肉过度扩张，就可能在小便时出现尿道刺痛症状，不过这种情况通常在排尿后症状可缓解。建议患者养成勤排尿的习惯，避免长时间憋尿。
二、尿路感染：患者憋尿时间过久，会致使大量细菌在泌尿系统滋生繁殖，进而破坏和侵入尿路上皮黏膜，引发尿路感染，此时就会有小便时尿道刺痛的临床表现。患者可在医生指导下服用左氧氟沙星胶囊、头孢菌素等药物进行治疗。
此外，当患者患有膀胱炎时，其典型表现为尿频、尿急、尿痛、排尿不适、下腹部疼痛等，部分患者还会迅速出现排尿困难的情况。患者可服用罗红霉素、多西环素等药物进行治疗。
总之，憋尿后小便时尿道刺痛要根据具体情况来判断和处理，如果症状持续不缓解或伴有其他异常表现，应及时就医，明确原因并进行针对性治疗。同时，日常生活中要注意养成良好的排尿习惯，避免憋尿等不良行为。