儿童脑炎的判断可以从症状表现、实验室检查以及影像学检查等方面来进行。一般来说，儿童患脑炎时可能会出现发热、头痛、呕吐等症状，部分患儿还可能有精神状态改变，比如烦躁不安、嗜睡甚至抽搐等表现。
症状表现判断
发热情况： 很多儿童脑炎患者会出现发热症状，体温可能会升高到38℃以上，而且发热可能会持续一段时间，有的可能持续数天。神经系统症状： 患儿可能会有头痛，婴儿可能表现为哭闹不安、囟门隆起等。还可能出现呕吐，且呕吐多为喷射性呕吐。另外，部分儿童会有精神萎靡、嗜睡的情况，严重的会出现抽搐，抽搐表现为肢体抽搐、双眼上翻等。
实验室检查判断
脑脊液检查： 这是诊断脑炎很重要的一项检查。通过腰椎穿刺获取脑脊液，若脑脊液中白细胞数明显增多，一般病毒性脑炎时白细胞数多在（10 - 500）×10⁶/L，细菌性脑炎时白细胞数可能更高，可达到（1000 - 10000）×10⁶/L等。同时，还可以通过脑脊液生化检查、病原学检查等进一步明确脑炎的类型，比如病毒性脑炎时脑脊液中病毒特异性抗体可能呈阳性等。血常规检查： 血常规检查中，白细胞计数及分类可能会有变化。细菌感染引起的脑炎，白细胞总数及中性粒细胞百分比通常会升高；病毒感染引起的脑炎，白细胞总数可能正常或轻度升高，淋巴细胞百分比可能升高。
影像学检查判断
头颅CT或MRI检查： 头颅CT在脑炎早期可能没有明显特异性改变，但随着病情发展，可能会发现脑实质有水肿、占位等情况。头颅MRI检查对脑组织的显示更为清晰，能更早发现脑炎引起的脑实质异常，比如病毒性脑炎可能会出现脑实质内片状长T1、长T2信号影等改变，有助于辅助判断脑炎的存在以及病情严重程度。