有巧克力囊肿是能够怀孕的，不过会使怀孕的难度增大，甚至有可能引发不孕。
巧克力囊肿一般指的是卵巢异位囊肿，也就是子宫内膜异位到卵巢部位而形成的囊肿，其对怀孕会产生一定的影响。一、如果卵巢巧克力囊肿体积较小，能够正常排卵，且月经周期规律，那么通常是可以怀孕的。在怀孕后需要定时进行产检以了解胚胎的发育状况，要高度警惕先兆流产、稽留流产等情况的发生。二、卵巢巧克力囊肿往往会加大怀孕的难度，也就是受孕困难，严重情况下甚至会导致不孕，其不孕率通常高达40%。卵巢巧克力囊肿造成不孕与盆腔微循环发生改变，对精卵结合及运送产生影响，免疫功能异常致使抗子宫内膜抗体增加有着密切关系。同时还可能会对卵巢功能产生影响，导致排卵障碍以及黄体形成不良。
总之，巧克力囊肿患者有怀孕的可能，但怀孕情况较为复杂，需要密切关注和针对性处理。