射精的时候痛可能由多种原因引起。比如生殖系统感染是常见原因之一，像附睾炎，据统计，青壮年男性中约有5% - 8%会患附睾炎，当附睾发生炎症时，射精过程中会刺激到炎症部位，导致射精疼痛。
生殖系统感染因素
附睾炎： 除了上述提到的青壮年易患外，长时间久坐、不注意个人卫生等都可能诱发附睾炎。炎症会让附睾组织充血、水肿，射精时肌肉收缩带动精液通过，就会引发疼痛。前列腺炎： 慢性前列腺炎在成年男性中的患病率较高，约占泌尿外科门诊患者的1/4左右。前列腺发炎时，腺体处于充血状态，射精时前列腺平滑肌收缩，会引起疼痛，还可能伴有尿频、尿急等症状。
结石相关因素
尿道结石： 如果尿道存在结石，结石会阻碍精液的排出，在射精过程中，尿道肌肉收缩推动精液通过时，就会摩擦结石部位，产生疼痛。而且结石长期存在还可能导致尿道黏膜损伤、感染等问题。精囊结石： 精囊结石相对少见，但也会引起射精疼痛。精囊内有结石时，射精时精囊收缩，结石刺激周围组织，导致疼痛，可能还会影响精液的质量。
其他因素
性生活不规律： 长期禁欲后突然频繁性交，或者性交过于剧烈、频繁，都可能导致生殖器官过度充血，从而在射精时出现疼痛。比如一些新婚夫妇，由于经验不足，性交过于频繁或激烈，容易引发这种情况。心理因素： 长期处于焦虑、紧张等不良心理状态下，也可能影响射精功能，导致射精时感觉疼痛。比如工作压力大、精神长期高度紧张的人群，可能会出现这种情况，但一般在调整心理状态后会有所缓解。