女性衣原体感染主要是由沙眼衣原体引起的。性传播是女性衣原体感染的主要原因之一，据统计，有过不洁性行为的女性感染衣原体的风险明显升高。
性传播途径
与感染者发生性行为： 当女性与携带衣原体的性伴侣发生无保护措施的性行为时，衣原体很容易通过性接触传播。比如，在一次性行为中，感染的概率虽然没有精确的固定数值，但相比没有高危性行为的女性，感染风险大幅增加。多个性伴侣： 拥有多个性伴侣的女性，感染衣原体的几率会比单一性伴侣的女性高很多。因为接触衣原体感染者的机会增多，从而增加了感染的可能性。
母婴传播
分娩时感染： 孕妇如果感染了衣原体，在分娩过程中，胎儿通过产道时就有可能被感染。新生儿可能会出现衣原体结膜炎或者衣原体肺炎等问题。比如，有研究发现，孕妇衣原体阳性时，约有30% - 50%的新生儿会受到感染。
间接接触传播
共用私人物品： 虽然这种传播方式相对少见，但如果女性与衣原体感染者共用毛巾、浴盆等私人物品，也存在感染风险。尤其是在卫生条件较差的环境中，衣原体在这些物品上存活一段时间后，接触的女性就有可能被感染。不过，这种情况的感染几率比性传播和母婴传播要低很多，但也不能完全忽视。公共场所接触： 在一些公共的浴室、游泳池等场所，如果被衣原体污染，女性接触后也有感染的可能，但一般来说，这种通过公共场所间接感染的情况发生概率较低，但仍需注意个人卫生防护。