肾结石微创手术费用在20000元至50000元不等。微创手术主要有以下两种：
一、输尿管软镜碎石取石术：适合处理2cm以下的较小肾结石，因其软镜较为细小，碎石和清石速度较慢，太大的结石往往一次难以清理干净。该软镜经尿道、膀胱、输尿管进入肾脏，属于自然腔道，无需打孔，具有出血少、创伤小、恢复快、痛苦小的特点。但软镜属于一次性耗材，仅软镜费用通常就达30000多元，再加上麻醉费、手术费以及药物等，通常总计需要50000元以上。
二、经皮肾镜碎石取石术：适合处理如鹿角样结石或多发结石等大结石。它是通过在皮肤及肾脏打孔后直接处理结石，然后将结石吸出，所以碎石和清石效率较高。经皮肾镜往往可重复使用，费用比软镜低，加上全麻手术和其他药物治疗等一般需要20000元至30000元左右。
总结概况提示：文章主要阐述了肾结石微创手术的两种方式，即输尿管软镜碎石取石术和经皮肾镜碎石取石术，分别介绍了它们的适用情况、手术特点以及大致费用。