肾结石微创手术费用跨度较大，在20000元到50000元不等。主要的微创手术有两种，分别是输尿管软镜碎石取石术和经皮肾镜碎石取石术。
一、输尿管软镜碎石取石术：
1.适用情况：适合处理2cm以下比较小的肾结石。
2.特点：软镜较为细小，碎石和清石速度较慢，对于太大的结石往往一次难以做干净。其通过经尿道、膀胱、输尿管进入到肾，属于自然腔道，无需打孔，因此出血和创伤较小，患者恢复较快，痛苦也较小。
3.费用方面：软镜属于一次性耗材，其本身费用通常就达30000多元，再加上麻醉、手术费以及药物等，总体通常需要50000元以上。
二、经皮肾镜碎石取石术：
1.适用情况：适合处理大结石，如鹿角样结石或多发结石。
2.特点：是经过皮肤及肾脏打孔后直接处理结石，然后将结石吸出，碎石和清石效率都较高。
3.费用方面：经皮肾镜往往可以重复使用，所以费用比软镜要低些，加上全麻手术和其他药物治疗等一般需要20000-30000元左右。
总之，肾结石微创手术的费用因手术方式不同而有较大差异，且每种手术方式都有其特点和适用情况。患者应根据自身结石情况，在医生的指导下选择合适的手术方式。