上腹部疼可能由多种原因引起，比如消化性溃疡，十二指肠溃疡的疼痛多在空腹时发作，约半数患者会在凌晨3点左右痛醒，而胃溃疡的疼痛多在进食后1小时内出现，经1-2小时后缓解。
消化系统疾病相关
胃炎：
急性胃炎：多因食用刺激性食物、酗酒或药物刺激等引起，会出现上腹部疼痛、恶心、呕吐等症状，严重时可能有呕血情况。慢性胃炎：多数人无明显症状，部分人会有上腹部隐痛、饱胀感，进食后可能加重，病程较长，有的会持续数月或数年。
胆道系统疾病：
胆囊炎：常在进食油腻食物后发作，右上腹或上腹部会出现疼痛，疼痛可放射至右肩或背部，还可能伴有恶心、呕吐等症状，急性胆囊炎发作时疼痛较为剧烈。胆结石：结石移动刺激胆囊或胆管时，会引起上腹部隐痛或绞痛，疼痛可能在进食后加重，有时会伴有黄疸、发热等表现。
其他系统疾病相关
心血管系统疾病：
心绞痛：部分患者疼痛可放射至上腹部，常为压榨性疼痛，持续时间一般3-5分钟，多在劳累、情绪激动时发作，休息或含服硝酸甘油后可缓解。心肌梗死：除了心前区疼痛外，也可能表现为上腹部疼痛，疼痛程度较剧烈，持续时间较长，可达数小时甚至更长，常伴有大汗、恶心、呕吐等症状。
胰腺疾病：
胰腺炎：急性胰腺炎多由暴饮暴食、酗酒等诱发，上腹部会出现剧烈疼痛，呈持续性刀割样痛，可向腰背部放射，同时伴有恶心、呕吐、发热等症状；慢性胰腺炎也会有上腹部隐痛，反复发作，可能伴有消化不良等表现。