如果眼睛里长了肉球，可采取手术治疗、药物治疗、生活调理等方式来处理。具体如下：
一、手术治疗：眼睛里长肉球，可能是眼睑板腺口堵塞，导致脂肪分泌物不能正常排出而形成的翼状胬肉，这时患者需要接受翼状胬肉切除术联合自体结膜移植术进行治疗。术后要精心做好眼部护理，以促进眼部尽快恢复。
二、药物治疗：在日常生活中，若眼部受到紫外线照射等，也可能引发眼睛里长出小肉球，并伴有疼痛感和瘙痒等症状。患者可在医生指导下使用氟米龙滴眼液、普拉洛芬滴眼液、硫酸卡那霉素滴眼液等药物进行治疗。
三、生活调理：患者在生活中要注意让眼部得到休息，避免长时间用眼而导致眼部疲劳，同时要保持眼部的清洁卫生，以防感染。在饮食方面，应以清淡为主，避免食用辛辣、刺激性食物。
总之，对于眼睛里长肉球的情况，要根据具体病因和症状选择合适的治疗方法，同时注意生活中的各种护理事项，以促进眼部健康的恢复。