运动后小腿疼痛可能由多种原因引起。一般来说，运动时小腿肌肉过度使用或拉伤等情况较为常见，比如在进行长跑等运动时，约有10% - 50%的人会出现运动后小腿疼痛的情况。
肌肉疲劳导致的疼痛
运动强度过大：当运动强度突然增加，比如平时很少运动的人突然进行长时间的快走或慢跑，小腿肌肉在短时间内承受了过多的负荷，就容易产生疲劳，进而引起疼痛。这种疼痛通常是酸痛感，休息一段时间后会有所缓解，但如果继续过度运动，疼痛可能会加重。运动前未充分热身：运动前没有进行适当的热身活动，小腿肌肉没有得到充分的准备，直接进入高强度运动状态，肌肉的伸展性和弹性不足，在运动过程中就容易受到损伤，引发疼痛。例如，直接开始剧烈的跳绳运动而没有先进行简单的腿部拉伸，就可能导致小腿疼痛。
肌肉拉伤引起的疼痛
运动姿势不当：在运动过程中，如果姿势不正确，比如跑步时步伐过大、落地姿势不正确等，会使小腿肌肉受到异常的牵拉，从而导致肌肉拉伤。比如打篮球时急停急转，小腿肌肉突然受到过度的牵拉，就可能发生拉伤，疼痛较为明显，可能还会伴有肿胀、淤血等情况。肌肉力量不平衡：如果小腿的某些肌肉过于紧张，而相对应的肌肉力量较弱，运动时就容易出现肌肉拉伤。例如，腓肠肌过于紧张，而比目鱼肌力量不足，在运动中就更容易发生拉伤，引起疼痛。
乳酸堆积造成的疼痛
运动中乳酸产生过多：当运动强度较大且持续时间较长时，身体的有氧代谢不能满足肌肉运动的需求，肌肉就会进行无氧呼吸，产生大量乳酸。如果乳酸堆积在小腿肌肉中，就会引起疼痛。一般在高强度运动后的1 - 2天内比较明显，比如进行了一次高强度的登山运动后，第二天小腿可能会感到酸痛，这就是乳酸堆积导致的。乳酸代谢较慢：有些人由于身体代谢乳酸的能力相对较弱，即使运动强度不是特别大，也可能出现乳酸堆积过多的情况，从而引起小腿疼痛。比如平时缺乏运动的人偶尔进行一次中等强度的运动，也可能会因为乳酸代谢慢而出现小腿酸痛。