扁桃体炎引起的高烧，可在医生的指导下使用以下药物进行治疗：
1.退烧药：如对乙酰氨基酚、布洛芬等，可以缓解发热症状。
2.抗生素：如果是细菌感染引起的扁桃体炎，需要使用抗生素进行治疗，如青霉素、头孢菌素等。
3.清热解毒药物：如双黄连口服液、清开灵颗粒等，可以清热解毒，缓解扁桃体炎的症状。
需要注意的是，在使用药物治疗的同时，还需要注意休息，多喝水，保持口腔清洁，避免食用辛辣、刺激性食物。如果高烧持续不退或出现其他症状，应及时就医。此外，对于儿童、孕妇、老人等特殊人群，应在医生的指导下使用药物。