胎记形成的原因较为复杂，主要与胚胎发育过程中的异常有关。据研究，大约有10%的新生儿会出现胎记。
遗传因素导致
基因变异影响： 某些胎记的形成与遗传基因的变异有关。如果家族中有胎记遗传的倾向，那么后代出现胎记的概率可能会相对较高。例如，一些特定类型的遗传性皮肤病可能会伴随胎记的出现。染色体异常关联： 染色体的异常也可能与胎记形成相关。在胚胎发育早期，染色体的结构或数目发生改变，可能干扰了皮肤组织的正常发育，从而导致胎记的产生。
胚胎发育过程中的因素
血管发育异常： 在胚胎发育的前8周，血管系统开始形成。如果在这个阶段血管发育出现异常，就可能形成血管型胎记，像鲜红斑痣就是由于胚胎时期血管发育畸形，导致真皮浅层毛细血管扩张所致。一般在出生时或出生后不久就会出现，且随着年龄增长可能会有所变化。色素细胞聚集： 对于色素型胎记，是因为在胚胎发育时，某些部位的色素细胞聚集异常。比如太田痣，就是胚胎发育过程中，黑素细胞从神经嵴向表皮移行时，未能穿过表皮、真皮交界，停留在真皮层导致的，通常在面部单侧出现，呈现灰蓝色的斑片。
外部环境因素影响
孕期不良生活习惯： 孕妇在孕期如果接触过多的辐射，比如经常接触电脑、手机等电子设备的辐射，或者长期处于有辐射的工作环境中，可能会增加胎儿出现胎记的风险。另外，孕期大量吸烟、饮酒，也可能干扰胎儿的正常发育，进而引发胎记。孕期药物影响： 孕妇在孕期不合理使用某些药物，也可能对胎儿的皮肤发育产生不良影响，导致胎记形成。不过这种情况相对较少见，但如果在不知情的情况下服用了可能影响胚胎发育的药物，就存在一定风险。