黄热病的症状通常分为不同阶段，在感染后的3-6天内，患者可能先出现急性病毒血症相关症状。初期症状类似流感，约50%的患者会有发热，体温可迅速升高到38℃以上，同时伴有头痛、全身乏力、肌肉疼痛，尤其是腰背部位较为明显，还可能出现食欲减退、恶心、呕吐等表现。
急性感染期症状
发热表现： 多数患者起病急骤，体温快速上升，可能在1-2天内达到39℃ - 40℃左右，发热可持续3 - 4天。全身不适： 除了肌肉痛、头痛外，还会感觉极度疲倦，整个人没什么力气，活动耐力明显下降。消化系统方面，恶心、呕吐较为常见，有些患者还会有腹痛症状，不过腹痛程度一般不太严重，但会影响进食。
缓解期症状
经过3 - 4天的发热期后，部分患者会进入缓解期，此时体温会有所下降，前面的全身不适症状也会暂时减轻，患者可能会感觉相对舒服一些，食欲也可能有所恢复，但这个缓解期通常比较短暂，一般只有1 - 2天。
中毒期症状
随后病情可能会加重进入中毒期，这时候又会出现发热，体温可能再次升高。同时会出现一系列重要脏器受损的表现，比如肝脏受累时，患者会出现黄疸，皮肤和巩膜发黄，血清胆红素水平升高，还可能伴有肝功能异常，像转氨酶升高等。肾脏也可能受到影响，出现蛋白尿、尿量减少等情况。严重时患者会出现出血倾向，比如牙龈出血、鼻出血，皮肤可能有瘀点、瘀斑等，这是因为肝脏受损后合成凝血因子减少，导致凝血功能障碍。此外，还可能出现烦躁不安、意识障碍等神经系统症状。