新生儿脐炎主要是由细菌感染引起的。通常在新生儿出生后的护理过程中，如果没有做好脐部的清洁卫生等，就容易引发脐炎。比如在新生儿出生后1周左右，若脐部护理不当，细菌就可能入侵导致脐炎。
病原菌方面的病因
金黄色葡萄球菌为主： 金黄色葡萄球菌是引发新生儿脐炎较常见的病原菌之一。它可以通过接触等途径污染脐部，进而在脐部繁殖生长，引起局部的炎症反应。大肠杆菌等其他细菌： 大肠杆菌也是导致新生儿脐炎的常见细菌。当新生儿的脐部被大肠杆菌污染后，细菌会在脐部的温暖、湿润环境中滋生，破坏脐部组织，引发炎症。
脐部护理不当导致的病因
清洁不及时： 新生儿的脐部如果长时间不清洁，会有污垢堆积，为细菌的滋生提供了良好的环境。例如，有的家长可能2 - 3天才给新生儿清洁一次脐部，这样就容易让细菌在脐部大量繁殖，从而引发脐炎。脐带结扎处理不当： 在新生儿脐带结扎时，如果操作不规范，比如结扎不紧等情况，会导致脐部愈合不良，使细菌更容易侵入。比如脐带结扎部位没有完全封闭好，外界的细菌就容易进入脐部创口，引发炎症。
免疫力因素相关的病因
新生儿自身免疫力低： 新生儿的免疫系统还没有完全发育成熟，抵抗力较弱。这使得他们更容易受到细菌等病原体的侵袭。相比成年人，新生儿对细菌的抵御能力差很多，所以更容易发生脐炎。母体免疫力传递不足： 虽然新生儿可以从母体获得一些抗体，但对于一些细菌的抵御可能不够。如果母体本身存在一些细菌携带情况，也可能影响新生儿脐部的防御，使得新生儿脐部在接触细菌时更容易发生感染，引发脐炎。