附件有囊肿的治疗方式需根据囊肿大小、性质等因素来定。一般来说，直径小于5厘米且无明显症状的附件囊肿，可定期复查，通常建议3~6个月做一次超声检查观察囊肿变化。
观察随访情况
无症状小囊肿：对于直径小于5厘米、超声提示为单纯性囊肿（无分隔、壁薄）且患者没有腹痛等不适症状时，医生通常会建议每3~6个月进行一次妇科超声复查，观察囊肿大小、形态等变化。生理性囊肿观察：部分附件囊肿可能是生理性的，比如黄体囊肿，常在月经后半期出现，一般在月经干净后复查超声，囊肿可能会自行消失，这种情况也需要定期复查监测。
手术治疗情况
囊肿较大或有症状时：当附件囊肿直径大于5厘米，或者观察期间囊肿持续存在、增大，或者怀疑囊肿有恶性倾向时，多需要手术治疗。手术方式有腹腔镜手术和开腹手术等。腹腔镜手术创伤小，恢复快，是常用的手术方式。一般来说，手术住院时间大概在3~7天左右。巧克力囊肿手术：如果是子宫内膜异位症引起的附件巧克力囊肿，对于有生育要求的年轻患者，可能会尽量保留生育功能进行手术；对于没有生育要求的较年长患者，可能会考虑做根治性手术。
药物辅助治疗情况
炎症相关囊肿：如果附件囊肿是由炎症引起的炎性包块，可在医生指导下使用抗生素进行抗感染治疗，常用的抗生素有头孢类、甲硝唑等。一般抗感染治疗需要持续1~2周左右，之后再复查超声看囊肿变化情况。激素相关囊肿：对于一些因激素水平异常导致的附件囊肿，比如多囊卵巢综合征患者可能出现的附件囊肿，可能会使用短效避孕药等调节激素水平的药物来辅助治疗，但药物治疗一般作为辅助手段，不能单纯依靠药物消除囊肿，仍需结合超声等检查监测囊肿变化。