导管内乳头状瘤的治疗方式需根据病情等因素决定，一般手术是主要的治疗手段。对于符合手术指征的患者，多数通过手术切除病灶来治疗。
手术治疗为主
局部切除： 适用于单发的导管内乳头状瘤，医生会将病变的导管及其周围乳腺组织切除，手术创伤相对较小，术后恢复较快。比如一些直径较小、局限在局部乳腺组织内的导管内乳头状瘤，多可选择这种方式。区段切除： 如果病变范围稍大，可能需要做乳腺区段切除，即切除包含病变导管的相应乳腺区段组织。这样能更彻底地清除病灶，降低复发风险。
观察随访情况
适用于特定人群： 对于年龄较大、身体状况较差、病变为多发且症状不明显的患者，可以考虑密切观察随访。一般建议每隔3 - 6个月进行乳腺超声、钼靶等检查，监测病变的变化情况。如果在观察过程中病变有增大、症状加重等情况，再考虑进一步治疗。
特殊情况处理
有恶变倾向者： 若经检查考虑导管内乳头状瘤有恶变倾向，如影像学检查发现肿块边界不清、有异常血流等情况，应积极采取手术等进一步治疗措施，必要时还可能需要扩大手术范围，甚至结合术后的辅助治疗等。妊娠期发现者： 妊娠期发现导管内乳头状瘤，由于孕期体内激素变化可能导致病变变化，一般建议在分娩后再根据具体情况决定是否手术。但如果出现乳头溢液伴有出血等明显不适症状，也需要及时咨询医生，评估是否需要手术干预。