怀孕45天做阴超或者腹部B超都行，但更建议做腹部B超。
一、怀孕初期胚胎发育不完善且不稳定，此时做B超检查较为合适，能有效查看受精卵在子宫内的具体情况。阴超在胚胎不稳定时可能引发阴道感染或出血。不过，孕妇若非常肥胖，阴超相对看得更清楚；但若孕妇有宫颈相关疾病如宫颈息肉或宫颈癌前病变等，则不能做阴超，应选择腹部B超。做腹式彩超需孕妇憋尿。
二、怀孕45天一般可看到宫腔内胎心和胎芽。
三、在怀孕45天还需口服叶酸，以预防胎儿神经管畸形。
总之，怀孕45天可根据自身情况选择合适的超声检查方式，同时要注意做好相关孕期保健措施。