淋菌性咽炎主要通过抗生素治疗，一般选用头孢曲松等药物，通常规范治疗1~2周左右可改善症状。
选用什么抗生素
头孢曲松：是治疗淋菌性咽炎常用的抗生素，它能抑制细菌细胞壁的合成，从而发挥杀菌作用，一般单次肌内注射即可。大观霉素：对于头孢类抗生素过敏的患者可考虑使用大观霉素，也是通过干扰细菌蛋白质合成来达到杀菌效果，通常需肌内注射。
治疗期间要注意啥
避免性生活：在治疗淋菌性咽炎期间一定要避免性生活，因为性生活可能会导致淋球菌传播给他人，一般需要持续到症状完全消失且经过复查确认治愈后才能恢复性生活。注意个人卫生：要保持口腔清洁，勤用温水漱口，每天至少漱口3~4次，保持口腔环境的清洁，有助于病情恢复。
特殊人群需特别留意
孕妇患者：孕妇患淋菌性咽炎时用药需格外谨慎，应在医生充分评估后选择相对安全的抗生素，因为一些抗生素可能会对胎儿产生影响，要权衡治疗效益和潜在风险来选择合适的药物。儿童患者：儿童患淋菌性咽炎较少见，若发生，需在医生指导下选用儿童适用的抗生素，严格按照儿童的体重等情况来确定用药方案，不能随意使用成人的抗生素剂量。