打孕酮针可能会有一些副作用。一般来说，打孕酮针常见的副作用有以下几方面情况。
局部皮肤反应方面
注射部位疼痛： 大约有部分人在打完孕酮针后，注射部位会出现疼痛感觉，有的可能是轻微隐痛，有的可能相对较明显，但多数在可耐受范围内。局部红肿： 少数人注射孕酮针后，注射部位会出现红肿现象，不过一般红肿程度较轻，在几天内可能会自行缓解。
身体全身反应方面
头晕乏力： 部分人打完孕酮针后会有头晕、乏力的感觉，这可能是药物引起的全身反应之一，一般休息后可能会有所减轻，但如果症状较严重，需及时告知医生。恶心呕吐： 个别人群在打孕酮针后可能出现恶心、呕吐的情况，这与药物对胃肠道的刺激等因素有关。
对月经及内分泌的影响方面
月经紊乱： 长期或不恰当使用孕酮针可能会影响月经周期，导致月经紊乱，比如原本规律的月经变得经期延长或缩短、经量异常等。内分泌失调： 孕酮针会影响体内的激素平衡，可能会引起内分泌失调相关的一些表现，不过通常在停药后身体会逐渐调整恢复，但具体恢复时间因人而异。