大拇指指甲凹陷可能是由以下原因引起的：
1.营养不良：缺乏某些维生素、矿物质或蛋白质可能导致指甲凹陷。例如，缺铁性贫血、维生素缺乏（如维生素A、E或B12）等。
2.甲癣：这是一种由真菌感染引起的指甲病变，常表现为指甲变厚、变色、凹陷或易碎。
3.扁平苔藓：这是一种自身免疫性疾病，可能影响指甲和皮肤，导致指甲出现凹陷、纵嵴和变色等症状。
4.银屑病：银屑病是一种慢性皮肤病，指甲病变是其常见的并发症之一，可能表现为指甲凹陷、增厚、变色和分离等。
5.湿疹：湿疹可以影响皮肤和指甲，导致指甲出现凹陷、粗糙和变色等问题。
6.外伤：指甲受到严重的外伤，如挤压、撞击或切割，可能导致指甲凹陷。
7.某些系统性疾病：某些系统性疾病，如甲状腺功能减退、心脏病、糖尿病等，也可能引起指甲凹陷。
8.遗传因素：某些遗传疾病可能导致指甲发育异常，包括凹陷。
如果发现大拇指指甲凹陷，建议及时就医，进行详细的身体检查和评估。医生可能会根据具体情况进行进一步的检查，如血液检查、真菌培养、皮肤检查等，以确定病因并制定相应的治疗方案。
此外，保持良好的指甲护理也很重要，包括定期修剪指甲、避免过度使用指甲、避免接触刺激性物质等。如果指甲凹陷是由营养不良引起的，通过改善饮食摄入足够的营养物质可能有助于改善指甲状况。
需要注意的是，对于一些严重的指甲问题，如指甲感染、自身免疫性疾病等，可能需要长期的治疗和管理。如果指甲凹陷伴有其他症状，如疼痛、肿胀、变色、易碎等，或者症状持续不缓解，应及时就医。同时，医生也会根据个人情况提供具体的建议和指导。