怀孕三个月时通过一些检查可以初步判断胎儿的性别，但需要注意的是，我国法律明确规定禁止非医学需要的胎儿性别鉴定，因此，医生通常不会在超声检查中告知胎儿的性别。
以下是一些可能用于判断胎儿性别的检查方法：
1.B超检查：在怀孕16-20周左右，B超检查可以通过观察胎儿的生殖器官来确定性别。但需要注意的是，此时胎儿的性别特征可能还不太明显，准确性可能受到多种因素的影响。
2.绒毛活检：在怀孕11-14周时，可以通过取胎儿绒毛进行细胞培养和染色体分析，以确定胎儿的性别。但绒毛活检是一种有创检查，存在一定的风险，如流产、感染等。
3.羊水穿刺：在怀孕16-22周时，可以通过抽取羊水进行细胞培养和染色体分析，以确定胎儿的性别。羊水穿刺也是一种有创检查，风险相对较高，如流产、感染等。
需要强调的是，无论采用哪种方法，确定胎儿性别都存在一定的误差，而且非医学需要的性别鉴定是违法行为。此外，胎儿的性别不应该成为关注的重点，而应该关注胎儿的健康和发育。在孕期，孕妇应该保持良好的生活习惯，均衡饮食，适量运动，定期进行产前检查，以确保胎儿的健康。