肝区隐痛可能由多种原因引起。比如，约15%-20%的慢性乙型肝炎患者会出现肝区隐痛的情况。
肝脏本身病变导致
肝炎： 像病毒性肝炎（甲肝、乙肝、丙肝等），乙肝病毒持续感染可能引发肝脏炎症，进而导致肝区隐痛。一般病程较长，可能数月甚至数年出现不适。肝脓肿： 细菌等病原体感染肝脏形成脓肿，会引起肝区持续或间歇性隐痛，同时可能伴有发热，体温可高达38℃~39℃甚至更高。
胆道系统问题引发
胆囊炎： 胆囊发炎时，炎症刺激可能放射到肝区导致隐痛，尤其在进食油腻食物后症状可能加重。慢性胆囊炎可能反复出现肝区隐痛，间隔时间不定。胆结石： 胆囊或胆管内有结石，结石移动刺激胆道，也会引起肝区隐痛，有时疼痛较为剧烈，呈阵发性。
邻近组织病变影响
胸膜炎： 胸膜发炎时，炎症波及到肝脏周围的胸膜，可导致肝区牵涉痛，疼痛与呼吸运动有关，深呼吸或咳嗽时疼痛可能加剧。肋骨病变： 肋骨骨折、肋软骨炎等肋骨相关病变，也可能被误以为是肝区隐痛。比如肋软骨炎，局部可能有压痛，疼痛部位比较固定。
其他可能因素
过度劳累： 长期过度劳累，身体免疫力下降，也可能出现肝区隐痛的情况，适当休息后部分人症状可缓解。但如果休息后无改善，就需要进一步检查。心理因素： 长期精神紧张、焦虑等心理因素，也可能导致躯体化症状，表现为肝区隐痛，但通过相关检查未发现肝脏有器质性病变。