咳嗽腹部两侧疼可能是用力过大引起，也可能是气管炎或支气管炎导致，还可能是腹部肌肉过度紧张所致。
一、当咳嗽较为严重时，局部用力过猛会导致腹部两侧疼，且若有严重的呼吸道感染也会引发这一症状。对此，应选择合适的治疗方法，可采用抗生素缓解病情，如阿莫西林胶囊、青霉素V钾片等。阿莫西林胶囊可用于敏感菌所致的各种感染；青霉素V钾片适用于青霉素敏感菌株所致的轻、中度感染等。
二、有的患者在咳嗽过程中出现严重腹部两侧疼，可能是由于气管炎或支气管炎感染引起，若有支原体感染也会出现类似症状。此时平时要多注意休息，食用清淡、易消化的食物等。
三、咳嗽会使患者腹部肌肉过度紧张，进而引发腹部两侧疼。针对这种情况要注意多休息，并可选择合适的止咳药物对症治疗，如复方甘草片、强力枇杷露等。复方甘草片具有镇咳祛痰的作用；强力枇杷露可养阴敛肺，止咳祛痰。
总之，咳嗽时腹部两侧疼的原因多样，需要根据具体情况采取相应的治疗措施。如果症状持续不缓解或加重，应及时就医。