严重的沙眼主要是由沙眼衣原体感染引起的。沙眼衣原体是一种微生物，它会感染眼部结膜和角膜，从而引发严重的沙眼。
衣原体的传播途径
直接接触传播： 比如与沙眼患者共用毛巾、洗脸盆等个人卫生用品，就有可能被传染。如果一个家庭中有成员患有沙眼，而大家共用毛巾，那么其他成员感染沙眼衣原体的风险就会增加。间接接触传播： 当沙眼患者的分泌物污染了物品，健康人接触这些被污染的物品后再接触自己的眼睛，也可能感染沙眼衣原体。例如，在公共的游泳池中，如果有沙眼患者，其分泌物污染了池水，其他人接触后不注意卫生，用手揉眼睛就容易被感染。
环境因素的影响
卫生条件差： 在卫生条件恶劣的环境中，沙眼衣原体更容易传播。比如一些贫困地区或者卫生设施不完善的地方，人们缺乏良好的个人卫生习惯，居住环境拥挤，这些都为沙眼衣原体的传播创造了有利条件。长期处于这样的环境中，感染严重沙眼的几率会大大提高。气候因素： 炎热、潮湿的气候也可能促进沙眼衣原体的传播和感染。在这样的气候条件下，沙眼衣原体的存活时间可能更长，而且人们可能因为出汗多等原因，更频繁地用手擦拭眼睛，增加了感染的机会。
自身免疫力因素
免疫力低下人群： 本身免疫力比较低的人，比如患有艾滋病等免疫缺陷疾病的患者，或者长期使用免疫抑制剂的人，更容易受到沙眼衣原体的侵袭，患上严重沙眼的可能性比免疫力正常的人要高很多。因为他们的身体抵御病原体的能力较弱，无法有效地清除沙眼衣原体，导致感染持续加重，发展成严重的沙眼。