治慢性咽炎并没有绝对最好的药物，常用的药物有含漱液、含片以及中成药等。一般来说，常用的含漱液如复方硼砂含漱液，可起到清洁口腔、杀菌消炎的作用；含片类的如西地碘含片，能直接作用于咽部，起到抑菌、消炎的效果。
含漱液类药物
复方硼砂含漱液： 它的主要成分是硼砂、碳酸氢钠等，能清洁口腔，抑制细菌生长，缓解咽部的炎症反应。使用时取适量含漱，一天3 - 4次。但需要注意，对其中成分过敏者禁用。呋喃西林含漱液： 可破坏细菌的酶系统，从而发挥杀菌作用，帮助减轻慢性咽炎引起的咽部不适，一般也是每日含漱数次。不过，孕妇和哺乳期女性使用时需谨慎，应在医生指导下权衡利弊后使用。
含片类药物
西地碘含片： 含服后，碘可逐渐释放，有强大的杀菌、抗感染作用，能有效改善慢性咽炎导致的咽部异物感、疼痛等症状。但对碘过敏者不能使用，而且长期含服可能会导致舌苔染色，停药后可消退。薄荷喉片： 含有薄荷脑等成分，能清凉止痛、杀菌消炎，可缓解慢性咽炎引起的咽干、咽痛等不适。不过，糖尿病患者要慎用，因为其中可能含有蔗糖等成分。
中成药类
咽炎片： 由玄参、天冬、牡丹皮等多种中药组成，具有养阴润肺、清热解毒、清利咽喉、镇咳止痒的功效，可用于慢性咽炎引起的咽干、咽痒、刺激性咳嗽等症状。但服药期间要忌辛辣、油腻食物，孕妇慎用。金嗓利咽丸： 能疏肝理气、化痰利咽，适用于慢性咽炎属痰湿内阻、肝郁气滞证者。在服用时要注意，忌烟酒、辛辣、油腻食物，若有高血压、心脏病、肝病、糖尿病、肾病等慢性病严重者应在医生指导下服用。