治慢性咽炎并没有绝对最好的药物，需根据不同情况选择。一般来说，常用的药物有含漱液、含片等。例如复方硼砂含漱液，可清洁口腔、杀菌消炎，缓解咽部不适。
局部含漱药物
复方硼砂含漱液： 它能利用药物成分清洁咽部，抑制细菌生长，通常每天含漱数次，能减轻咽部的炎症反应，帮助缓解咽干、咽痛等症状。不过，对该含漱液成分过敏者禁用。呋喃西林溶液： 同样具有杀菌作用，可用于清洁口腔和咽喉，抑制局部细菌繁殖，使用时按照一定的浓度稀释后含漱，能改善慢性咽炎引起的不适。但使用过程中若出现过敏等不适反应需立即停药。
含片类药物
西瓜霜含片： 具有清热解毒、消肿止痛的功效，含服时能直接作用于咽部病变部位，缓解咽部肿痛、干燥等症状。不过，糖尿病患者应慎用，因为其中可能含有糖类成分。度米芬含片： 能抑制和杀灭细菌，对多种革兰阳性菌及阴性菌有作用，含服后可减轻慢性咽炎导致的咽部异物感等不适。但本品可能会引起局部刺激，如出现皮疹等过敏反应应停药。
中成药类
金嗓利咽丸： 有燥湿化痰、疏肝理气的作用，对于慢性咽炎属痰湿内阻、肝郁气滞证者有一定疗效。孕妇慎用，在服用期间要避免食用辛辣、油腻食物。清喉利咽颗粒： 能清热利咽、宽胸润喉，可缓解慢性咽炎引起的咽喉发干、声音嘶哑等症状。糖尿病患者禁服该颗粒，因为其含有蔗糖等成分。