黑指甲的治疗需先明确病因，不同病因治疗方式不同。如果是外伤导致甲下出血引起的黑指甲，若出血较少，一般不需要特殊治疗，随着指甲生长，淤血会逐渐排出，通常2~3个月左右新指甲长出后，黑指甲会消失。
外伤引起的黑指甲处理
轻度外伤： 如果是因轻度挤压等外伤造成甲下少量出血形成黑指甲，受伤初期可在24小时内进行冷敷，减少出血和肿胀，每次冷敷15~20分钟，每天可冷敷3~4次。受伤24小时后改为热敷，促进淤血吸收，每天热敷2~3次，每次15~20分钟。重度外伤： 若外伤较严重，指甲下积血较多，出现明显疼痛等不适，可能需要就医，由医生进行处理，如在严格消毒下穿刺放血等。
真菌感染导致的黑指甲治疗
外用抗真菌药： 对于轻度的由真菌感染引起的黑指甲，可以使用外用抗真菌药物，如阿莫罗芬搽剂等。使用时要注意按照说明书规范用药，一般需要坚持使用数周甚至数月，才能看到效果。口服抗真菌药： 如果真菌感染较严重，外用药物效果不佳，可能需要口服抗真菌药物，如伊曲康唑等，但口服抗真菌药有一定的肝肾毒性等风险，需要在医生严格评估下使用，医生会根据患者的肝肾功能等情况来决定是否使用及调整用药方案。
某些全身性疾病引起的黑指甲治疗
维生素缺乏相关： 如果是由于维生素缺乏等全身性疾病因素导致的黑指甲，需要补充相应的维生素。比如因缺乏维生素B12导致的相关情况，需要在医生指导下补充维生素B12制剂。一般来说，通过补充维生素后，随着身体对维生素的吸收利用，黑指甲情况可能会逐渐改善，但具体改善时间因人而异，可能需要数周甚至数月。其他全身性疾病： 若是由其他全身性疾病，如心脏病、雷诺病等引起的黑指甲，需要积极治疗原发疾病。比如心脏病患者需要根据病情进行相应的治疗，如药物治疗、手术治疗等，随着原发疾病得到控制，黑指甲情况也可能会有所好转，但治疗周期会因原发疾病的复杂程度等而不同。