治疗神经性头疼并没有绝对最好的药，常用的有非甾体抗炎药、特异性治疗药物等。一般来说，非甾体抗炎药中的布洛芬等，可能对部分神经性头疼有缓解作用，不过具体效果因个体而异。
非甾体抗炎药类
布洛芬： 属于非甾体抗炎药，通过抑制前列腺素合成发挥镇痛作用，能缓解轻至中度的神经性头疼。但要注意，有消化道溃疡病史的人要慎用，因为它可能会刺激胃肠道。阿司匹林： 同样是非甾体抗炎药，也可用于缓解神经性头疼。不过，对阿司匹林过敏的人不能用，而且它可能会引起胃肠道不适，比如恶心、呕吐等。
特异性治疗药物类
曲坦类药物： 像舒马曲坦，它是5 - 羟色胺受体激动剂，能特异性地作用于脑血管，收缩扩张的血管，从而缓解神经性头疼。不过，有心血管疾病风险因素的人使用时要谨慎，因为它可能会影响心血管系统。麦角胺类药物： 麦角胺咖啡因片也可用于神经性头疼的治疗，它能收缩血管，减轻头疼症状。但这类药物有一定的副作用，比如可能会引起恶心、呕吐等，而且不能长期大量使用。
其他辅助药物类
B族维生素： 维生素B1、B12等B族维生素对神经系统有一定的保护作用。比如维生素B1可以参与神经系统的代谢，维生素B12有助于维持神经髓鞘的完整性。虽然它不是直接针对头疼的药物，但对于一些由于神经功能紊乱引起的神经性头疼，辅助补充B族维生素可能有一定的帮助作用。抗抑郁药物： 部分抗抑郁药物也可用于神经性头疼的辅助治疗，如阿米替林。这类药物可以通过调节神经递质来改善头疼症状，但使用时要注意它可能会引起嗜睡、口干等副作用，而且需要在医生的指导下使用，因为剂量和用药时间都需要严格把控。