男性尿痛主要由多种原因引起，其中泌尿系统感染较为常见，约有30% - 50%的男性尿痛是由尿路感染导致的。
泌尿系统感染导致的尿痛
尿道炎： 淋菌性尿道炎多由淋病奈瑟菌感染引起，患者会出现尿频、尿急、尿痛，尿道口还可能有脓性分泌物。非淋菌性尿道炎主要由衣原体、支原体感染所致，症状相对较轻，有尿道刺痒、尿痛及少量分泌物等表现。膀胱炎： 急性膀胱炎患者会有尿痛、尿频、尿急，严重时可出现血尿，排尿终末时疼痛较为明显，还可能伴有下腹部疼痛。慢性膀胱炎则表现为长期反复的尿痛、尿频等症状。
泌尿系统结石引发的尿痛
尿道结石： 尿道结石会导致排尿困难、点滴状排尿，同时伴有尿痛，疼痛可放射至阴茎头部。膀胱结石： 主要症状为排尿突然中断，伴剧烈疼痛，疼痛可放射至阴茎头部和远端尿道，改变体位后又可继续排尿，尿痛在排尿过程中较为明显。
前列腺炎造成的尿痛
急性细菌性前列腺炎： 患者会出现尿频、尿急、尿痛，还可伴有发热、寒战、乏力等全身症状，会阴部及耻骨上区域有重压感。慢性前列腺炎： 表现为尿频、尿急、尿痛，尿不尽感，有时会有会阴部、下腹部隐痛等不适，疼痛可在排尿后或久坐后加重。
其他原因导致的尿痛
性传播疾病： 如尖锐湿疣、梅毒等，也可能引起男性尿痛，同时会伴有生殖器部位的皮损、溃疡等症状。过敏反应： 对某些物质过敏，如使用某些避孕套、洗浴用品等，可能导致尿道局部过敏，出现尿痛、瘙痒等症状。