小脑萎缩的成因较为复杂，可能由多种因素导致。比如遗传性因素，某些基因突变会引发遗传性小脑萎缩，像脊髓小脑性共济失调就有多种亚型，是由不同基因的突变引起，这类疾病有一定的遗传概率，家族中有相关病史的人群需格外关注。
遗传因素导致
某些基因变异： 有一类遗传性的小脑萎缩，是由于特定基因发生了变异。例如脊髓小脑性共济失调相关基因出现突变，就可能使得患者逐渐出现小脑萎缩的情况。这种遗传因素导致的小脑萎缩往往有家族遗传倾向，如果家族中有亲属患有此类遗传性小脑萎缩疾病，那么家族中的其他人患病风险会相对增高。
神经系统变性疾病引发
多系统萎缩： 这是一种神经系统变性疾病，其中会包含小脑萎缩的表现。患者除了小脑萎缩外，还可能伴有自主神经功能障碍、锥体外系症状等。目前对于多系统萎缩导致的小脑萎缩具体机制还在研究中，但它是导致小脑萎缩的一个重要的神经系统变性疾病因素。橄榄桥脑小脑萎缩： 这也是神经系统变性疾病的一种，主要病理改变就是橄榄核、桥脑基底核和小脑皮质的萎缩。患者会出现共济失调、构音障碍等症状，随着病情进展，小脑萎缩会逐渐明显，严重影响患者的运动功能和生活质量。
其他因素影响
慢性酒精中毒： 长期大量饮酒的人容易出现小脑萎缩。酒精会对小脑等神经系统产生毒性作用，长期慢性酒精中毒会损害小脑的神经细胞，导致小脑组织逐渐萎缩。研究发现，长期酗酒10年以上的人群，发生小脑萎缩的概率会明显高于不饮酒或少量饮酒的人群。某些药物或毒素暴露： 长期接触某些有毒物质或者服用特定药物也可能引起小脑萎缩。比如长期接触重金属如汞、锰等，这些重金属会在体内蓄积，损害神经系统，包括小脑，导致小脑萎缩。还有一些药物如果使用不当，也可能对小脑造成损伤，不过这种情况相对较少见，但也是需要注意的因素。