跑步时肚子右侧疼痛常由以下情况导致：饭后跑步、腹壁软组织挫伤、呼吸节奏紊乱以及原发病发作。
一、饭后跑步：饭后胃肠处于消化吸收阶段，此时进行剧烈运动，不但会对食物消化吸收产生不良影响，而且会牵拉胃黏膜，从而引发疼痛。这是因为进食后，胃内充满食物，身体为了消化食物，大量血液会流向胃肠道，此时跑步，会使原本应该集中在胃肠道的血液流向四肢等部位，导致胃肠道供血相对不足，影响消化功能，同时胃也会因为剧烈运动而受到牵拉，进而引起疼痛。
二、腹壁软组织挫伤：跑步力度过猛时，可能会造成腹壁软组织肌肉拉伤，进而导致腹痛。这主要是由于过度用力使腹壁肌肉承受了超出其承受能力的负荷，引起肌肉纤维的撕裂和损伤，产生疼痛。
三、呼吸节律紊乱：跑步过程中若呼吸调节不当，会致使呼吸节律紊乱，组织无法充分获得氧气，引起膈肌痉挛，进而引发疼痛。正常情况下，呼吸应该是平稳而有规律的，在跑步时，如果呼吸太浅或太深、太快或太慢，都可能打破这种平衡，导致氧气供应不足，引起膈肌的不规律收缩，产生疼痛。
四、原发病：若本身患有急慢性阑尾炎、泌尿系统结石、卵巢输卵管疾病等，剧烈运动可能会牵拉到病变部位，从而引起腹痛。因为这些疾病本身就存在病变组织，在运动时，身体的震动和肌肉的牵拉更容易刺激到这些病变部位，引发疼痛。
总之，在跑步时应放慢速度，恰当调整呼吸节律，如果长时间未跑步，需要做好跑前拉伸运动。另外，若胸腹部患有疾病，是不适合进行剧烈运动的。要根据自身情况，合理安排跑步活动，以避免出现不适症状。