小脑萎缩的病因较为复杂，可能由多种因素引起。其中遗传因素是一个重要方面，约有50%的小脑萎缩患者存在基因突变等遗传倾向，比如某些常染色体显性遗传疾病会导致小脑萎缩的发生。
遗传因素相关
基因突变导致：一些特定的基因发生突变，会使小脑的神经细胞逐渐退化，引发小脑萎缩。例如脊髓小脑性共济失调相关的基因变异，就会造成小脑功能逐渐丧失，出现共济失调、步态不稳等症状，这类遗传因素导致的小脑萎缩往往有家族遗传史，家族中可能有多代人患病。
神经系统疾病引发
多发性硬化：这是一种中枢神经系统炎性脱髓鞘疾病，当病变累及小脑时，就可能引起小脑萎缩。患者除了有小脑萎缩的表现外，还可能出现视力下降、肢体无力等多种神经系统症状，病情会逐渐进展，影响患者的运动、感觉等多方面功能。帕金森病晚期：帕金森病是常见的神经系统退行性疾病，在疾病的晚期阶段，部分患者会出现小脑萎缩的情况。此时患者除了有帕金森病的典型表现如震颤、肌强直、运动迟缓外，还会伴有平衡障碍、共济失调等小脑受损的症状，严重影响患者的生活自理能力。
中毒因素影响
酒精中毒：长期大量饮酒的人容易出现小脑萎缩。酒精中的有害物质会对小脑的神经细胞产生毒性作用，破坏神经细胞的结构和功能，导致小脑逐渐萎缩。长期饮酒者如果出现走路不稳、协调能力下降等症状，就要考虑酒精中毒性小脑萎缩的可能，及时戒酒并进行相关治疗有助于延缓病情进展。药物中毒：某些药物长期或过量使用也可能导致小脑萎缩。比如长期大量使用抗癫痫药物苯妥英钠，可能会对小脑造成损害，引发小脑萎缩。因此在使用这类可能有神经系统副作用的药物时，要严格遵循医嘱，密切观察身体反应，一旦出现异常要及时就医调整用药。