阴茎皮有小疙瘩可能由多种原因引起。比如珍珠状阴茎丘疹，这是一种常见的良性病变，多见于20 - 40岁左右的男性，表现为阴茎冠状沟处有珍珠状、半透明的小疙瘩，通常无自觉症状，不需要特殊治疗。
一、珍珠状阴茎丘疹：
成因： 目前认为可能与局部刺激有关，比如包皮过长、个人卫生状况差等因素可能有一定关联，但具体机制还不十分明确。特点： 一般是沿冠状沟排列的小疙瘩，颜色多为白色、黄色或淡红色，大小比较均匀，质地较硬。通常不会引起疼痛、瘙痒等不适症状，对健康也没有太大影响。
二、尖锐湿疣：
成因： 由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起，主要通过性接触传播。特点： 初期可能是小而柔软的淡红色丘疹，逐渐增大增多，形态多样，可呈乳头状、菜花状、鸡冠状等，疙瘩表面凹凸不平，湿润柔软，容易出血。患者可能会有局部瘙痒、灼痛等感觉，如果不及时治疗，疣体可能会逐渐增大。
三、皮脂腺异位症：
成因： 是由于皮脂腺生理变异而发生在阴茎部位的病变。特点： 表现为阴茎皮肤上出现无明显隆起的、针头大小的黄白色小疙瘩，多发生于阴茎龟头、包皮等部位。一般没有不适症状，对健康通常也没有危害。
四、阴茎皮毛囊炎：
成因： 多是由于细菌感染引起，比如不注意阴茎局部的清洁卫生，导致毛囊堵塞，细菌滋生感染。特点： 起初可能是局部出现红色丘疹，随后可发展为丘疹性脓疱，周围有红晕，有疼痛或瘙痒感，疙瘩中心可能有毛发穿过。如果病情进一步发展，脓疱可能会破裂、结痂。