怀孕三个月头疼可能由多种因素引起，包括睡眠不足、妊娠合并高血压、偏头痛以及其他情况。具体如下：
一、睡眠不足：怀孕三个月时孕妇若睡眠时间短或睡眠易觉醒导致睡眠不足，就可能使大脑缺血、缺氧，进而引发头疼、头晕等症状。此时需要孕妇对睡眠进行调理，做到早睡早起，避免长时间熬夜，养成良好的睡眠习惯，让大脑得到充分休息，以改善头疼症状。
二、妊娠合并高血压：若怀孕三个月的孕妇出现明显血压升高或存在妊娠合并高血压，可导致脑血管压力增大，从而出现头疼、头晕、眼花、耳鸣、视物模糊、胸闷等症状。孕妇应在专业医生指导下，根据病情使用降压药物进行治疗，同时要定期监测血压，及时调整药物剂量，并加强日常生活和饮食的调理，以促使病情尽快改善。
1.药物治疗：专业医生会根据具体情况选择合适的降压药物。
2.血压监测：定期测量以了解血压变化。
3.生活饮食调理：低盐饮食，保证充足休息等。
三、偏头痛：怀孕三个月时孕妇若情绪过度紧张、焦虑，心理压力大，可能诱发偏头痛发作，出现头疼、视物模糊、头晕等症状。此时孕妇可轻柔按摩头部，尽量不选用止痛药物，同时积极调理心态，保持乐观。
四、其他：怀孕三个月时孕妇若受凉感冒，也可引起头疼，还可能伴有鼻塞、流涕、头晕等症状，可在医生指导下服用蒲地蓝消炎口服液等药物，同时要注意多喝水。
总之，怀孕三个月头疼的原因多样，需要根据具体情况进行针对性处理，以缓解症状，保障孕妇和胎儿的健康。