怀孕三个月头疼可能由多种因素引起，包括睡眠不足、妊娠合并高血压、偏头痛以及其他情况等，要根据具体病情选择合适治疗以缓解症状。具体如下：
一、睡眠不足：怀孕三个月时，若孕妇睡眠时间短或睡眠易觉醒导致睡眠不足，可使大脑缺血缺氧，进而引起头疼、头晕等症状。此时孕妇需进行睡眠调理，做到早睡早起，避免长时间熬夜，养成良好睡眠习惯，让大脑充分休息，以改善头疼症状。
二、妊娠合并高血压：孕妇怀孕三个月时若出现血压明显升高或存在妊娠合并高血压，会致使脑血管压力增大，从而引发头疼、头晕、眼花、耳鸣、视物模糊、胸闷等症状。孕妇可在专业医生指导下，依据病情使用降压药物治疗，同时要定期监测血压并及时调整药物剂量，还需加强日常生活饮食调理，以促使病情尽快好转。
三、偏头痛：怀孕三个月时，若孕妇情绪过度紧张、焦虑，心理压力大，可能诱发偏头痛发作，出现头疼、视物模糊、头晕等症状。孕妇可轻柔按摩头部，尽量不使用止痛药物，同时积极调理心态，保持乐观。
四、其他：怀孕三个月时，若孕妇受凉感冒，也会引起头疼，还可能伴有鼻塞、流涕、头晕等症状。此时可在医生指导下服用蒲地蓝消炎口服液等药物，且要注意多喝水。
总之，怀孕三个月头疼的原因多样，需要仔细分析并采取针对性措施进行处理。