皮脂腺囊肿主要是由于皮脂腺排泄管阻塞，皮脂腺囊状上皮被逐渐增多的内容物膨胀所形成的潴留性囊肿。其形成原因主要有以下几方面：
毛囊皮脂腺导管堵塞
毛囊皮脂腺导管角化： 皮肤中的毛囊皮脂腺导管会随着新陈代谢不断更新，如果导管发生角化异常，就会导致管腔狭窄或阻塞。比如，青春期时，由于体内激素水平变化，皮脂腺分泌旺盛，导管角化可能会相对加剧，增加堵塞风险。据研究，青春期人群皮脂腺囊肿的发生率相对会高一些。角质碎屑堆积： 正常情况下，皮肤表面会有角质细胞不断脱落，如果毛囊皮脂腺导管堵塞，角质碎屑就会在导管内堆积，使得皮脂腺分泌物无法正常排出，进而形成囊肿。
皮脂腺分泌旺盛
激素水平影响： 雄激素水平升高会促使皮脂腺分泌增加。例如，青春期男性雄激素分泌增多，皮脂腺分泌旺盛，就更容易出现皮脂腺导管堵塞从而形成囊肿。女性在月经前期，体内激素波动也可能导致皮脂腺分泌相对旺盛，增加长皮脂腺囊肿的可能性。饮食因素： 高糖、高脂饮食会刺激皮脂腺分泌。比如长期大量食用巧克力、油炸食品等，会使皮脂腺分泌过多油脂，如果不能及时通过导管排出，就容易引发皮脂腺囊肿。有调查显示，经常摄入高糖高脂食物的人群，皮脂腺囊肿的发病几率比饮食清淡人群高约20%。
皮肤卫生状况不佳
清洁不彻底： 日常不注意皮肤清洁，污垢、灰尘等容易堵塞皮脂腺导管。比如长时间不洗脸，面部皮肤的污垢会堆积，尤其是T区（额头、鼻子、下巴部位）皮脂腺分布多，更容易出现问题。细菌感染： 皮肤表面的细菌，如痤疮丙酸杆菌等，可能会参与皮脂腺囊肿的形成过程。当皮肤卫生差时，细菌容易滋生，感染皮脂腺导管，导致导管炎症性堵塞，进而促使囊肿形成。比如背部皮肤因为不易清洁，又经常出汗，细菌容易繁殖，所以背部也是皮脂腺囊肿的好发部位之一。