皮脂腺囊肿主要是由于皮脂腺排泄管阻塞，皮脂腺囊状上皮被逐渐增多的内容物膨胀所形成的潴留性囊肿。一般来说，毛囊皮脂腺口堵塞是引发皮脂腺囊肿的关键原因。
毛囊皮脂腺口堵塞因素
皮肤代谢因素： 皮肤的角质层会不断代谢更新，正常情况下角质细胞会随着代谢脱落，但如果皮肤代谢出现异常，角质细胞就容易堆积，从而堵塞毛囊皮脂腺口。比如青少年时期，由于激素水平变化，皮肤油脂分泌旺盛，同时角质代谢可能相对活跃且容易出现紊乱，就增加了毛囊皮脂腺口堵塞的几率。清洁不当因素： 日常不注意皮肤清洁，皮肤表面的灰尘、油污等容易混合皮脂堆积在毛囊口，进而堵塞皮脂腺排泄管。像一些油性皮肤的人，如果长时间不洗脸或者清洁不彻底，就更易出现这种情况。
皮肤损伤相关因素
外伤影响： 皮肤受到外伤时，比如擦伤、抓伤等，外界的细菌、灰尘等容易进入毛囊皮脂腺内，引发炎症反应，导致皮脂腺排泄管阻塞。例如皮肤被尖锐物体划伤后，如果没有及时清洁消毒，就可能增加皮脂腺囊肿发生的风险。医源性损伤： 在一些医疗操作中，如果损伤了皮脂腺及其排泄管，也可能导致皮脂腺囊肿。比如皮肤手术过程中，如果对皮脂腺区域处理不当，破坏了正常的皮脂腺结构，就有可能引发潴留性囊肿。
其他潜在因素
遗传倾向： 有研究发现，皮脂腺囊肿可能存在一定的遗传易感性。如果家族中有亲属患有皮脂腺囊肿，那么个体患病的几率可能相对较高。不过具体的遗传机制还在进一步研究中，但这也提示遗传因素是其中一个可能的潜在原因。内分泌失调影响： 内分泌失调也可能与皮脂腺囊肿的形成有关。比如雄激素水平升高会导致皮脂腺分泌旺盛，当分泌过于旺盛而排泄管又不畅时，就容易形成囊肿。像一些内分泌紊乱的患者，或者处于青春期雄激素分泌旺盛的人群，相对更容易出现皮脂腺囊肿。