婴儿蛋白质过敏是否会自愈需视过敏严重程度而定，部分情况是会自愈的。
一、婴儿蛋白质过敏的原因。婴儿蛋白质过敏是由于摄入含蛋白质的食物后，免疫系统将其误判为入侵病原，进而释放出特异性免疫球蛋白，并与食物结合形成诸多化学物质，从而引发过敏症状。
1.轻度症状情况。如果婴儿蛋白质过敏症状较轻，仅表现为皮肤红肿，那么在远离过敏原后通常是会自愈的。
2.重度症状情况。但要是婴儿蛋白质过敏症状较为严重，如出现皮肤红肿、喉头疼痛、皮肤瘙痒、腹泻等多种症状时，一般来说婴儿蛋白质过敏是难以自愈的。对于症状严重的患儿，需要及时在医生指导下口服抗过敏药物进行治疗，比如西替利嗪、氯雷他定片等，同时还可局部涂抹炉甘石洗剂，其具有止痒作用，能缓解皮肤瘙痒症状。
二、日常生活注意事项。婴儿蛋白质过敏在日常生活中一定要远离含蛋白质的食物，以免反复接触过敏食物而导致婴儿反复过敏。
总之，婴儿蛋白质过敏的自愈情况因症状严重程度而异，且在生活中要做好相应防护。